23.15 Edit This 0 Comments »
ENDONUKLEASE RESTRIKSI
by Desti Herawati, 17 Mei 2010
Enzim restriksi merupakan enzim yang memotong molekul DNA. Karena enzim ini memotong di bagian dalam molekul DNA, maka enzim ini juga dinamakan endonuklease restriksi. Enzim ini memotong (menghidrolisis) DNA pada rangka gula-fosfat tepatnya pada ikatan fosfodiester. Enzim restriksi akan mengenali dan memotong DNA hanya pada urutan nukleotida tertentu, biasanya sepanjang 4 hingga 6 pasang basa.
Enzim restriksi ditemukan pada bakteri. Strain bakteri yang berbeda akan menghasilkan enzim restriksi yang berbeda pula, sehingga penamaan enzim restriksi pun diambil dari strain bakteri dimana enzim tersebut diisolasi. Huruf pertama berasal dari nama genus, dua huruf selanjutnya berasal dari nama species bakteri tersebut, kemudian huruf berikutnya yang selalu ditulis dalam huruf kapital merupakan kode untuk strain dan urutan penemuan, sebagai contoh:
- BamHI - berasal dari Bacillus amyloliquefaciens
- HindIII - berasal dari Haemophilus influenza
- PstI - berasal dari Providencia stuartii
- Sau3AI - berasal dari Staphylococcus aureus
- AvaI - berasal dari Anabaena variabilis
- EcoRI - berasal dari Escherichia coli, dengan R yakni RY13 (strain) dan I (urutan penemuan)
Enzim restriksi memiliki beberapa karakteristik, diantaranya:
a. Enzim restriksi mengenali urutan nukleotida spesifik
b. Enzim restriksi memotong ikatan fosfodiester diantara basa spesifik, satu di setiap helai DNA.
Hasil dari masing-masing reaksi tersebut yakni dua buah fragmen DNA untai ganda.
c. Enzim restriksi tidak membeda-bedakan antara DNA yang berasal dari organisme yang berbeda.
Sebagian besar enzim restriksi akan memotong DNA yang mengandung urutan pengenalan mereka, tidak mempermasalahkan sumber DNA tersebut.
d. Enzim restriksi merupakan bagian alami dari sistem pertahanan bakteri.
b. Enzim restriksi memotong ikatan fosfodiester diantara basa spesifik, satu di setiap helai DNA.
Hasil dari masing-masing reaksi tersebut yakni dua buah fragmen DNA untai ganda.
c. Enzim restriksi tidak membeda-bedakan antara DNA yang berasal dari organisme yang berbeda.
Sebagian besar enzim restriksi akan memotong DNA yang mengandung urutan pengenalan mereka, tidak mempermasalahkan sumber DNA tersebut.
d. Enzim restriksi merupakan bagian alami dari sistem pertahanan bakteri.